在最近的一项研究中，位于UT的西南大学的科学家们开发了一种新的方法来研究T细胞的分子特征。这种方法今天发表在"自然方法"(NatureMethods)杂志上，使研究人员更容易分析T细胞受体(TCR)的作用。TCR是一种识别T细胞表面病原体的分子。
人口与数据科学助理教授、研究小组组长道王博士说："这让人们能够更好地理解T细胞是如何工作的，以及利用T细胞对抗疾病的新方法。
虽然有些免疫细胞可以同时攻击不同的病原体，但T细胞更有针对性--每个T细胞表面都有一组独特的T细胞受体(TCR)。每个T细胞受体通常只识别一个特定分子或"抗原"。例如，一个TCR可能只与肺癌中发现的一种蛋白质结合，而另一个TCR可能只与一种流感病毒结合。当T细胞遇到与其TCR中的一种T细胞结合的抗原时，它们就会被激活，从而产生免疫反应。为了抵抗各种潜在的入侵者，人类体内有数以百万计的不同种类的T细胞。
科学家们正试图研究是什么使不同的T细胞和TCR更有效，但到目前为止，由于缺乏有关各种TCR功能的信息，他们认为具有相似外观的TCR必须与相似的抗原结合，所有TCR都以类似的方式激活T细胞。
作为回应，研究小组开发了一种统计模型，将现有的两种技术结合起来：tcr分析(用于测量人类tcr多样性)和单细胞RNA测序(用于识别T细胞中打开或关闭的特定基因)。将这些技术结合起来一直是一个挑战，因为每个实验都产生了数千个数据，数据以两种不同的形式出现。新的模型，称为tessa，使用了强大的统计方法来弥补这一差距。tessa揭示了当tcr识别单个T细胞中的抗原时会发生什么情况，以及TCR如何影响T细胞的功能。
研究人员使用泰莎对来自健康人群和癌症患者的100288个T细胞进行了研究。在癌症患者中，他们发现T细胞中TCR的多样性对T细胞功能的影响要弱于健康患者。这可能是因为在肿瘤微环境中分泌的大量其他免疫分子以其他方式影响T细胞的活动。这一发现和其他的发现，可能是由于泰莎的广泛应用，可能会对设计基于免疫的癌症治疗方法的科学家产生影响。
DavidGerber博士是加州大学西南大学HaroldC.Simmons综合癌症中心的内科教授和临床研究副主任，他认为这项工作为使用单个T细胞测序数据提供了一种新的方法。
UTSW放射肿瘤学助理教授ToddAguilera博士补充道："以前的技术涉及T细胞的确切功能以及T细胞受体如何与功能相关的推测。我相信这种方法可以帮助识别最有前途的TCR，为基于TCR的个性化免疫治疗提供帮助，并更好地定义生产性免疫反应，指导确定最佳的免疫治疗策略。
